Forschung

Tumorproben für die Forschung werden meist ohne standardisierte Prozeduren und zu unkontrollierten Zeitpunkten nach der Tumorresektion gewonnen. Als Folge verändern verschiedene exogene Faktoren die Molekularbiologie der Krebszellen auf eine Weise, die zwischen den einzelnen Proben variiert. Insbesondere die Hypoxie und die Temperaturabnahme des resezierten Tumors außerhalb des Körpers verändern die Genexpression und andere molekulare Merkmale auf variable Weise.

Aus diesem Grund sind ein großer Teil der bisher entdeckten Targets und Biomarker aus der verzerrten Biologie solcher Tumorproben entstanden. Sie haben eine geringe Reproduzierbarkeit und haben daher keine medizinische Relevanz1,2. Für dieses Problem haben wir Lösungen auf zwei Ebenen entwickelt:

  1. Gewinnung und Lagerung von Proben. Wir haben eine Methode zur Gewinnung und Lagerung von Tumorproben entwickelt, welche die Mehrheit der exogenen Faktoren eliminiert und die übrig gebliebenen Faktoren standardisiert. Auf diese Weise bewahren die Forschungsproben für eine lange Zeit die authentische Molekularbiologie, die die Tumorzellen im Körper des Patienten hatte. In einer Reihe von Experimenten generierten Tumorproben, die mit unserer Methode gewonnen wurden, selbst nach sieben Jahren Lagerung hochqualitative und reproduzierbare DNA, RNA, Proteine und histologische Schnitte.
  2. Target Discovery und Biomarkerforschung. Wir haben eine Strategie zur Entdeckung von Targets und Biomarkern entwickelt, die auf einer qualitativ hochwertigen Biobank basiert. Die Proben werden nach unserer Methode gewonnen und gelagert (s. oben). Die zu erhebenden Patientenparameter werden so ausgewählt, dass sie den medizinischen Zustand beschreiben, den der Target oder die Biomarker darstellen soll. Die aus den Proben gewonnenen molekularen Daten und ihre Korrelation mit den Patientendaten können zur Entdeckung echter Targets und Biomarker mit höchster Reproduzierbarkeit und medizinischer Treffsicherheit führen.
     
    1. Alymani NA, Smith MD, Williams DJ & Petty RD (2010) Predictive biomarkers for personalized anti-cancer drug use: discovery to clinical implementation. Eur J Cancer 46: 869-879.
    2. Maxim B et al. (2012), Impact of Collection and Storage of Lung Tumor Tissue on Whole Genome Expression Profiling. JMD 12(2): 140-148.